Intonasi adalah ① Tinggi rendah bunyi dalam keseluruhan kalimat, ② Tinggi rendah bunyi pada akhir kalimat. Sama seperti bahasa lainnya, Intonasi dalam bahasa Jepang memiliki tinggi-rendah bunyi yang dapat membedakan makna. Contoh, ① Dalam pembicaraan yang berbentuk narasi, awal kalimat diucapkan dengan nada tinggi kemudian semakin turun sehingga berbentuk seperti huruf hiragana「へ」(he). ② Pada saat bertanya, diucapkan dengan nada akhir tinggi “taberu↗” (makan↗), tetapi pada saat menjawab, diucapkan dengan nada akhir turun “taberu↘” (makan↘).